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得益于下一代测序数据、生物信息学和电子临床工具的支持,以及融资状况的改善,数字医疗的趋势日趋清晰。

AquaBounty公司已经向其表明了转基因三文鱼的安全性,并对这些不育的转基因三文鱼逃出繁殖水箱,并与野生三文鱼成功交配可能造成的环境风险进行了估计。对于AquaBounty公司而言,这100吨转基因三文鱼是一个来之不易的奖励。

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他指出,中国对GM技术投资巨大,并且正在研发多种GM农场动物。AquaBounty公司完成了FDA所要求的提交内容。Walton 补充道,如果Recombinetics对农产品进行投资的话,他们可能会先在美国之外的其他地区进行销售。乍看之下,巴拿马渔场似乎难以成为AquaBounty公司财政繁荣的关键所在。2012:FDA在五月份完成环境评估草案的起草,但是直到十二月份才将其公之于众。

在最后关头,AquaBounty公司获得了再融资,并新获得了Intrexon公司(一家合成生物学公司,总部位于弗吉尼亚州的布莱克斯堡)的投资,最终幸存了下来。AquaBounty公司的这场长期战斗已经打消了美国其他公司生产食用型GM动物的念头。据BIOFAB公司的合伙人之一——美国加利福尼亚州斯坦福大学(Stanford University in California)的合成生物学家Drew Endy介绍,人们可能会认为,只要进行了遗传学改造的操作,那么被改造的细胞(或者生物)就应该按照设计发生预计的改变,就好像平时对大肠杆菌进行的那些试验操作一样,可实际情况并不是这样的

Endy与劳伦斯伯克利国家实验室(Lawrence Berkeley National Laboratory in Berkeley, California)的Adam Arkin(他是BIOFAB公司的另一位创办人)发现,其实我们很难预测这些基因的表达活性。这样科学家们就可以有大约93%的机率得到超过期望中的表达量一倍的蛋白产物。同时核糖体结合位点(ribosome binding site, RBS)也非常重要,因为这是决定RNA翻译成蛋白质的关键。但是首先得让细胞的翻译机器认识这条外源的核酸,即必须要让细胞认出DNA上的启动子序列,这样才能开始转录,生成RNA产物。

该业务能够帮助生物学家们更有目的性地从事遗传学改造方面的工作,从而推进合成生物学研究更快步入工业化生产水平。这一直是困扰科学家们的一个大问题,哪怕是在大肠杆菌这个被我们应用了几十年,应该是科学家们相当熟悉的工程菌当中也同样存在这个问题。

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同时Elfick认为,从事合成生物学研究的人应该都非常明白,如果要让图纸上的设计在细胞里成为现实,还有很长的一段路要走。BIOFAB公司是依靠美国国家科学基金会(US National Science Foundation)提供的140万美元作为启动资金,于2009年成立的一家新兴公司,他们主要专注于高端的合成生物学业务,目前提供的主要服务是为客户提供标准化的、能够控制基因表达水平的DNA零部件。他们的客户——分布于全球的生物学家可以利用这些标准化的零部件对各种各样的细胞进行各种遗传学改造,比如往细胞里塞入一些外源基因,使细胞具备某些符合我们人类需要的功能和特性,满足医学等各个领域的需要,造福人类等。Arkin和Endy还引用了之前的一项研究成果支持他们的发现,这项之前的研究发现,在科研人员们试图表达某种蛋白的时候,他们只有大约50%的机率得到超过期望中的表达量一倍的蛋白产物。

Endy和Arkin的团队还开发了一款统计软件,能够对他们的RBS和启动子组合的表达活力进行统计和评价,当然今后也可以对任何应用于合成生物学操作的遗传元件进行评价。也就是说无论它们下游的基因是什么样的序列,理论上都能够被启动表达,这可以对基因表达进行更强的控制。所以BIOFAB公司才想到了将RBS和启动子组合起来的主意,我们知道大肠杆菌的RBS和启动子序列的活性与下游的被调控基因是无关的。英国爱丁堡大学(University of Edinburgh, UK)的合成生物学家Alistair Elfick也认为,BIOFAB公司的服务可以帮助他们这些合成生物学家设计出规模更大、而且更复杂的人工生物系统。

在近30年里,科学家们收集了大量的核酸序列信息,也成功地表达了很多种目的蛋白。Endy和Arkin使用荧光蛋白编码基因对外源基因的表达活性进行了研究,他们在这个基因的上游插入了不同的启动子和RBS序列,并对各种启动子和RBS序列组合的转录活性(即产生的荧光强度)进行了比较,可结果却一团糟,因为同一对启动子与RBS序列组合后针对不同的基因会产生不同的转录活性。

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不过这些外源序列如果要很好地应用于合成生物学工作,首先需要克服一个大难题,那就是服从性的问题,即如何保证序列插入细胞之后能够按照我们的预计,发挥它应有的功能。通常来说,如果要让一个细胞表达某个基因,那么首先应该将一条目的基因转入细胞内,然后促进它转录、翻译成我们需要的蛋白质。

其中有一些序列的表达水平非常高,可是有一些的表达水平却又非常弱,每条基因表达产物的量相差非常悬殊。这么低的成功率可是让合成生物学家们头痛的大问题,因为他们往往需要在细胞中表达好几十个基因,用这些基因的表达产物构建一套新的体系,随便一个基因的表达量达不到要求都会让整个工作功亏一篑。这家公司就是总部位于美国加利福尼亚州埃默里维尔市(Emeryville, California)的BIOFAB公司,他们自称是世界上第一家专注于生物设计——制造服务(design-build)的公司。据BIOFAB公司的合伙人之一——美国加利福尼亚州斯坦福大学(Stanford University in California)的合成生物学家Drew Endy介绍,人们可能会认为,只要进行了遗传学改造的操作,那么被改造的细胞(或者生物)就应该按照设计发生预计的改变,就好像平时对大肠杆菌进行的那些试验操作一样,可实际情况并不是这样的。这款软件还能够让研究人员自己为任意一个生物学系统创建一个工作表,方便他们开展工作和相互之间进行交流。Randy Rettberg是在美国马萨诸塞州坎布里奇一家非盈利组织——iGEM基金会(iGEM Foundation in Cambridge, Massachusetts)工作的一名合成生物学家,他曾经与Endy共同开展过类似的工作,他认为今后会有更多的实验室选择BIOFAB的服务,以工业化生产的方式构建人工合成的生物系统。

他们近日在《自然方法》(Nature Methods)杂志网络版上发表了两篇论文,介绍了他们在这方面取得的工作成绩。最近在互联网上又刚刚上线了一家电子商务网站,不过这家网站销售的可不是普通的商品,他们提供的是DNA业务。

Nature:世界首家DNA业务电子商务网站 2013-05-11 16:22 · wenmingw 总部位于美国加利福尼亚州埃默里维尔市的BIOFAB公司,自称是世界上第一家专注于生物设计——制造服务(design-build)的公司。BIOFAB公司的创办人Drew Endy(左)和Adam Arkin(右)BIOFAB公司最先开展的业务主要针对的是大肠杆菌的DNA序列,他们可以非常精确地对大肠杆菌基因的活性进行调控。

据Arkin介绍,他们提供的这些序列已经给他的多位同事提供了非常大的帮助。BIOFAB公司最先开展的业务主要针对的是大肠杆菌的DNA序列,他们可以非常精确地对大肠杆菌基因的活性进行调控

转基因作物在发展中国家快速增长 2013-05-11 16:00 · johnson 国际农业生物技术应用服务组织(ISAAA)日前发布年报称,2012年,发展中国家转基因作物种植面积首次超过发达国家,占全球种植总面积的52%。在未来,仅仅在亚洲,会有10亿贫困的水稻种植者从转基因水稻中获益。中国科学院遗传与发育研究所研究员朱桢表示,过去20年来,全球种植了几亿公顷转基因作物,数亿人食用了转基因食品,尚无科学结论证明其有害。然而,发展中国家却日益意识到种植转基因作物所带来的益处:不仅能提升产量,而且能节省能源、时间和机械,并能减少杀虫剂的使用,提高产品质量。

这一年,有来自28个国家的1730万农民种植了转基因作物,其中85%来自中国、印度、菲律宾。耐旱性是制约全球作物产量提高的重要因素,而通过转基因作物获得的耐旱性状也被看作是转基因作物商业化的最重要性状。

其中,棉花是中国的主要转基因作物,720万小型、资源匮乏型农户种植了400万公顷转基因棉花,种植率高达80%,平均每个农民种植0.5公顷。在中国,转基因玉米的种植面积可能会达到3000万公顷。

节省了4.73亿公斤的杀虫剂。值得一提的是,复合性状是转基因作物的重要特点。

巴西将在今年首次种植抗虫和耐除草剂复合性状大豆。印度尼西亚可能会种植耐旱甘蔗。国际农业生物技术应用服务组织(ISAAA)日前发布年报称,2012年,发展中国家转基因作物种植面积首次超过发达国家,占全球种植总面积的52%。《中国科学报》记者从ISAAA中国生物技术信息中心获悉,全球前5个种植转基因作物的发展中国家是中国、印度、巴西、阿根廷及南非,这5个国家共种植了7820万公顷的转基因作物,占全球转基因作物种植面积的46%。

他坦言,我国在一些转基因作物的科研领域并不落后,只是成果未及时推广,希望政府相关决策更快速明朗。然而,发展中国家却日益意识到种植转基因作物所带来的益处。

克莱夫•詹姆士称,从1996年至2012年,来自全球约30个国家的数百万农民种植了转基因作物,这是对生物技术作物益处的最有力的证明。在1996年转基因技术商业化之前,评论家就曾表示转基因作物仅为发达国家使用,发展中国家不会接受并采用转基因作物。

亚洲还有一些发展中国家在2015年之前将首次种植转基因作物。2012年复合性状转基因作物的种植面积是4370万公顷,约占全球总面积的26%,而2011年,这个数字是4200万公顷。

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